Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC035044E0CXF8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC035044E0CXF8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC035044E0CXF8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC035044E0CXF8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BC035044E0CXF8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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