Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21560D3Z7A4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21560D3Z7A4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms