Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rdh8D3Z6W3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh8D3Z6W3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms