Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms