Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms