Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc170D3YXL0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc170D3YXL0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms