Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4950D3YUM8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm4950D3YUM8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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