Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d4D3YUH6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms