Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna7C0LLJ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms