Protein–RNA interactions for Protein: C0HKE2

Hist1h2ac, Histone H2A type 1-C, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2acC0HKE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2acC0HKE2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hist1h2acC0HKE2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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