Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pnldc1B2RXZ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms