Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms