Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms