Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clrn2B2RVW2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clrn2B2RVW2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clrn2B2RVW2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clrn2B2RVW2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clrn2B2RVW2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clrn2B2RVW2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms