Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp964B2RR88 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp964B2RR88 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms