Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2012B1B0R1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms