Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CK137956B1AYM9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CK137956B1AYM9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms