Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-M5A7VMS3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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