Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skint4A7TZF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skint4A7TZF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms