Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Arid3cA6PWV5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Arid3cA6PWV5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arid3cA6PWV5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms