Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms