Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms