Protein–RNA interactions for Protein: A2BG94

Gm6890, Predicted gene 6890, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6890A2BG94 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6890A2BG94 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6890A2BG94 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms