Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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