Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a3A2AVZ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc43a3A2AVZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms