Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf2A2AT37 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms