Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper2A2ARP9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper2A2ARP9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms