Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb1A2AQ07 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms