Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms