Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FocadA2AKG8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms