Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm12A2AJ77 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms