Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms