Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms