Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trav12-2A0N8N6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Trav12-2A0N8N6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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