Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28360A0A087WR25 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms