Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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