Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp2Q06649 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms