Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp1P55194 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp1P55194 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp1P55194 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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Sh3bp1P55194 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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