Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PtpreP49446 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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PtpreP49446 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtpreP49446 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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