Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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