Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp2Q06649 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms