Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Hoxd9P28357 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Hoxd9P28357 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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