Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb2P0C1T1 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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