Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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