Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usf3B2RUQ2 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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