Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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