Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RpainQ9CWY9 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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