Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms