Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Krt40Q6IFX3 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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