Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms